Mikrobiologia lekarska Jeziorany

Nowoczesny podręcznik mikrobiologii lekarskiej napisany przez znanych i doświadczonych polskich wykładowców akademickich w tej dziedzinie. W książce omówiono poszczególne grupy drobnoustrojów: bakterie, wirusy, grzyby i pasożyty oraz ich chorobotwórczość i znaczenie w medycynie. Wiele uwagi poświęcono również nowoczesnym metodom diagnostycznym, epidemiologii, zakażeniom szpitalnym i postępowaniu leczniczemu. Bogaty materiał ilustracyjny – liczne kolorowe ryciny i schematy są doskonałą pomocą w przygotowaniu się do zajęć praktycznych i egzaminów. Publikacja adresowana jest do studentów wydziałów lekarskich oraz innych kierunków medycznych, lekarzy i diagnostów specjalizujących się w dziedzinach obejmujących wiadomości z mikrobiologii, a także do osób, którym w codziennej praktyce zawodowej niezbędna jest wiedza z tej dziedziny. Spis treści: Wykaz Autorów V Przedmowa IX 1. Historia mikrobiologii - Marian Binek 1.1. Mikrobiologia XIX i początku XX w. zdominowana przez mikrobiologię medyczną 1.2. Dyscypliny towarzyszące mikrobiologii medycznej 1.2.1. Wakcynologia 1.2.2. Higiena i antyseptyka 1.2.3. Chemioterapia 2. Wprowadzenie do epidemiologii chorób zakaźnych - Andrzej Zieliński 2.1. Proces zakaźny 2.2. Szerzenie się chorób zakaźnych w populacji 2.3. Epidemiologia opisowa i analityczna 2.4. Badania przyczynowości w epidemiologii 2.5. Nadzór epidemiologiczny 3. Dezynfekcja, sterylizacja i antyseptyka - Małgorzata Fleischer 3.1. Dezynfekcja 3.1.1. Zasady dezynfekcji 3.1.2. Mechanizm działania środków dezynfekcyjnych 3.1.3. Metody dezynfekcji 3.2. Sterylizacja 3.2.1. Zasady prawidłowej sterylizacji 3.2.2. Metody sterylizacji 3.2.3. Kontrola procesu sterylizacji 3.3. Dekontaminacja przy podejrzeniu skażenia prionami 3.4. Antyseptyka 4. Immunoprofilaktyka zakażeń czynna i bierna - Janusz Ślusarczyk 4.1. Uodpornienie człowieka i jego rodzaje 4.2. Mechanizmy odporności nieswoistej 4.3. Mechanizmy odporności swoistej 4.4. Odporność poszczepienna 4.4.1. Definicje szczepionki i szczepienia 4.4.2. Cele programów szczepień ochronnych 4.4.3. Charakterystyka szczepionek 4.4.4. Immunogenność szczepionek 4.4.5. Zastosowanie syntetycznych peptydów i DNA jako immunogenów szczepionkowych 4.5. Szczepionki przeciwwirusowe 4.5.1. Rodzaje i swoistość szczepionek przeciwwirusowych 4.5.2. Perspektywy zwalczania zakażeń wirusowych 4.6. Immunoprofilaktyka bierna zakażeń 4.6.1. Immunoglobuliny ludzkie 4.6.2. Humanizowane przeciwciała monoklonalne 4.6.3. Antytoksyny zwierzęce 4.7. Szczepienia u osób podróżujących 4.7.1. Zasady zapobiegania chorobom zakaźnym podczas podróży 4.7.2. Sytuacja epidemiologiczna w miejscu docelowym podróży 4.7.3. Szczepienia ochronne zalecane podróżnym 5. Bakteriologia ogólna z patogenezą zakażeń bakteryjnych 5.1. Klasyfikacja bakterii - Artur Drzewiecki 5.2. Budowa i fizjologia bakterii - Artur Drzewiecki 5.2.1. Budowa komórki bakterii 5.2.2. Metabolizm bakterii 5.2.3. Wzrost bakterii 5.2.4. Biofilm 5.3. Genetyka bakterii - mechanizmy warunkujące zmienność genomów i proteomów bakteryjnych - Elżbieta Katarzyna Jagusztyn-Krynicka, Paweł Łaniewski 5.3.1. Genomy bakteryjne 5.3.2. Plastyczność genomów bakteryjnych 5.3.3. Zmienność proteomów bakteryjny 5.3.4. Fenotypowa różnorodność populacji bakteryjnych 5.4. Patogeneza zakażeń bakteryjnych - Barbara Różalska, Beata Sadowska 5.4.1. Podstawowe mechanizmy patogenności bakterii 5.4.2. Unikanie działania mechanizmów obronnych gospodarza 5.5. Flora fizjologiczna i jej rola w obronie przed zakażeniami - Piotr B. Heczko 5.5.1. Nabywanie mikrobiomu 5.5.2. Skład mikrobiomu człowieka 5.5.3. Wpływ mikrobiomu na odporność 5.5.4. Choroby związane z zaburzeniami mikrobiomu 6. Bakteriologia szczegółowa 6.1. Ziarenkowce Gram-dodatnie - Małgorzata Bulanda 6.1.1. Rodzaj Staphylococcus 6.1.2. Rodzaj Micrococcus 6.1.3. Rodzaj Streptococcus 6.1.4. Rodzaj Enterococcus 6.2. Ziarenkowce Gram-ujemne - Artur Drzewiecki 6.2.1. Rodzaj Neisseria 6.2.2. Rodzaj Moraxella 6.2.3. Bakterie z grupy HACEK 6.3. Laseczki Gram-dodatnie niewytwarzające spor - Gayane Martirosian 6.3.1. Rodzaj Corynebacterium 6.3.2. Rodzaj Listeria 6.3.3. Rodzaj Erysipelothrix 6.4. Laseczki Gram-dodatnie wytwarzające spory - Gayane Martirosian 6.4.1. Rodzaj Bacillus 6.4.2. Rodzaj Clostridium 6.5. Pałeczki Gram-ujemne: Enterobacteriaceae, Vibrionaceae, Aeromonadaceae - Hanna Stypułkowska-Misiurewicz 6.5.1. Rodzaj Escherichia 6.5.2. Rodzaj Salmonella 6.5.3. Rodzaj Shigella 6.5.4. Rodzaj Yersinia 6.5.5. Rodzaj Plesiomonas 6.5.6. Inne rodzaje należące do Enterobacteriaceae 6.5.7. Rodzaj Vibrio 6.5.8. Rodzaj Aeromonas 6.6. Pałeczki Gram-ujemne niefermentujące glukozy - Pseudomonas, Acinetobacter, Stenotrophomonas, Burkholderia - Eugenia Gospodarek 6.6.1. Rodzaj Pseudomonas 6.6.2. Rodzaj Acinetobacter 6.6.3. Rodzaj Stenotrophomonas 6.6.4. Rodzaj Burkholderia 6.7. Pozostałe pałeczki Gram-ujemne: Bordetella, Haemophilus, Pasteurella, Francisella, Bartonella, Brucella, Campylobacter, Helicobacter, Legionella - Hanna Stypułkowska-Misiurewicz 6.7.1. Rodzaj Bordetella 6.7.2. Rodzaj Haemophilus 6.7.3. Rodzaj Pasteurella 6.7.4. Rodzaj Francisella 6.7.5. Rodzaj Bartonella 6.7.6. Rodzaj Brucella 6.7.7. Rodzaj Campylobacter 6.7.8. Rodzaj Helicobacter 6.7.9. Rodzaj Legionella 6.8. Bakterie beztlenowe niewytwarzające spor - Gayane Martirosian 6.8.1. Rodzaj Bacteroides 6.8.2. Rodzaj Prevotella 6.8.3. Rodzaj Porphyromonas 6.8.4. Rodzaj Fusobacterium 6.8.5. Rodzaj Veillonella 6.8.6. Rodzaje Peptococcus i Peptostreptococcus 6.8.7. Rodzaj Propionibacterium 6.8.8. Rodzaj Lactobacillus 6.8.9. Rodzaj Eubacterium 6.8.10. Rodzaj Bifidobacterium 6.8.11. Rodzaj Gardnerella 6.8.12. Rodzaj Mobiluncus 6.9. Prątki Mycobacterium - Zofia Zwolska 6.10. Krętki - Marian Binek 6.10.1. Rodzaj Borrelia 6.10.2. Rodzaj Treponema 6.10.3. Rodzaj Leptospira 6.10.4. Rodzaj Brachyspira 6.11. Promieniowce i pokrewne bakterie - Marian Binek 6.11.1. Rodzaj Actinomyces 6.11.2. Rodzaj Nocardia 6.11.3. Rodzaj Rhodococcus 6.11.4. Inne pokrewne bakterie 6.12. Chlamydie - Barbara Zawilińska 6.12.1. Rodzaj Chlamydia 6.12.2. Rodzaj Chlamydophila 6.13. Mykoplazmy - Barbara Zawilińska 6.14. Inne bakterie - Rickettsiaceae, Anaplasmataceae i Coxiellaceae - Barbara Zawilińska 7. Wirusologia ogólna - Marta Wróblewska 7.1. Struktura i klasyfikacja wirusów 7.1.1. Struktura wirusów 7.1.2. Klasyfikacja wirusów 7.2. Cykl replikacyjny wirusów 7.2.1. Przyleganie wirusa do komórki (adsorpcja) 7.2.2. Wnikanie wirusa do komórki (penetracja) 7.2.3. Odpłaszczenie kwasu nukleinowego wirusa 7.2.4. Synteza białek wczesnych 7.2.5. Replikacja genomu i synteza białek strukturalnych wirusa (eklipsa) 7.2.6. Składanie i dojrzewanie potomnych wirionów (morfogeneza) 7.2.7. Uwolnienie potomnych wirionów z komórki 7.2.8. Cykl replikacyjny poszczególnych grup wirusów 7.3. Genetyka wirusów 7.3.1. Zmienność genetyczna wirusów 7.3.2. Oddziaływanie wirusów w zakażeniach mieszanych 7.3.3. Wirusy jako wektory 7.4. Patogeneza zakażeń wirusowych 7.4.1. Zakażenia miejscowe i uogólnione 7.4.2. Relacje wirus - komórka gospodarza 7.4.3. Relacje wirus - organizm gospodarza 7.4.4. Zakażenia latentne 7.5. Odporność gospodarza na zakażenia wirusowe 7.5.1. Mechanizmy immunologiczne w zakażeniach wirusowych 7.5.2. Czynniki warunkujące odporność gospodarza na zakażenia wirusowe 7.5.3. Rola układu odpornościowego w patogenezie zakażeń wirusowych 7.5.4. Mechanizmy unikania przez wirusy odpowiedzi immunologicznej gospodarza 7.6. Wirusy a onkogeneza 7.6.1. Patogeneza nowotworów o etiologii wirusowej 7.6.2. Onkogenne wirusy RNA 7.6.3. Onkogenne wirusy DNA 7.7. Epidemiologia zakażeń wirusowych 7.7.1. Definicje i wskaźniki epidemiologiczne 7.7.2. Czynniki wpływające na epidemiologię chorób wirusowych . 7.7.3. Drogi szerzenia się zakażeń wirusowych 7.7.4. Zakażenia wirusowe u podróżnych 7.7.5. Nowe i nawracające zakażenia wirusowe 7.8. Zapobieganie zakażeniom wirusowym 7.8.1. Zasady kontroli zakażeń wirusowych 7.8.2. Szczepionki 7.8.3. Surowice odpornościowe 8. Wirusologia szczegółowa 8.1. Herpeswirusy - Magdalena Kosz-Vnenchak, Sława Szostek 8.1.1. Wirusy opryszczki zwykłej 8.1.2. Wirus ospy wietrznej i półpaśca 8.1.3. Wirus cytomegalii 8.1.4. Wirus Epsteina-Barr 8.1.5. Ludzki herpeswirus 6 8.1.6. Ludzki herpeswirus 7 8.1.7. Ludzki herpeswirus 8 8.2. Adenowirusy - Tomasz Dzieciątkowski 8.2.1. Postacie kliniczne zakażeń adenowirusami 8.2.2. Diagnostyka laboratoryjna zakażeń adenowirusowych 8.2.3. Leczenie i profilaktyka chorób o etiologii adenowirusowej 8.3. Pokswirusy - Maciej Przybylski 8.3.1. Wirus ospy prawdziwej 8.3.2. Wirus mięczaka zakaźnego 8.4. Parwowirusy - Tomasz Dzieciątkowski 8.4.1. Postacie kliniczne zakażeń parwowirusem B19 8.4.2. Diagnostyka laboratoryjna zakażeń parwowirusem B19 8.4.3. Leczenie i profilaktyka zakażeń parwowirusowych . 8.5. Poliomawirusy - Tomasz Dzieciątkowski 8.5.1. Postacie kliniczne zakażeń poliomawirusami 8.5.2. Diagnostyka laboratoryjna zakażeń poliomawirusami 8.5.3. Leczenie i profilaktyka chorób spowodowanych przez poliomawirusy 8.6. Papillomawirusy - Tomasz Dzieciątkowski 8.6.1. Choroby o etiologii HPV 8.6.2. Diagnostyka laboratoryjna zakażeń HPV 8.6.3. Leczenie i profilaktyka zakażeń HPV 8.7. Ortomyksowirusy - Maciej Przybylski 8.7.1. Epidemiologia grypy 8.7.2. Patogeneza i obraz kliniczny grypy 8.7.3. Diagnostyka laboratoryjna grypy 8.7.4. Leczenie i profilaktyka grypy 8.8. Pikornawirusy - Maciej Przybylski 8.8.1. Enterowirusy niepoliomielityczne z gatunków A-D 8.8.2. Poliowirusy 8.8.3. Rinowirusy 8.8.4. Parechowirusy 8.9. Paramyksowirusy - Maciej Przybylski 8.9.1. Wirus odry 8.9.2. Wirus świnki 8.9.3. Syncytialny wirus oddechowy (wirus RS) 8.9.4. Wirusy paragrypy 8.9.5. Ludzki metapneumowirus 8.10. Koronawirusy - Marta Wróblewska 8.10.1. Ludzkie koronawirusy 8.10.2. Koronawirus ciężkiego ostrego zespołu oddechowego (SARS-CoV) 8.10.3. Koronawirus MERS 8.10.4. Ludzki torowirus 8.11. Astrowirusy - Marta Wróblewska 8.11.1. Epidemiologia zakażeń astrowirusami 8.11.2. Patogeneza i obraz kliniczny zakażeń astrowirusami 8.11.3. Diagnostyka laboratoryjna zakażeń astrowirusami 8.11.4. Leczenie i profilaktyka zakażeń astrowirusami 8.12. Kaliciwirusy - Marta Wróblewska 8.12.1. Norowirusy 8.12.2. Sapowirusy 8.12.3. Diagnostyka laboratoryjna zakażeń kaliciwirusami 8.12.4. Leczenie i profilaktyka zakażeń kaliciwirusami 8.13. Reowirusy - Marta Wróblewska 8.13.1. Rodzaj Rotavirus 8.13.2. Rodzaj Coltivirus 8.13.3 Rodzaje Orbivirus, Seadornavirus i Orthoreovirus 8.14. Togawirusy - Marta Wróblewska 8.14.1. Wirus różyczki 8.14.2. Wirusy końskiego zapalenia mózgu 8.14.3. Kompleks serologiczny wirusa gorączki lasu Semliki 8.14.4. Wirus Sindbis 8.15. Flawiwirusy - Marta Wróblewska 8.15.1. Wirus żółtej gorączki 8.15.2. Wirus dengi 8.15.3. Kompleks serologiczny wirusa japońskiego zapalenia mózgu 8.15.4. Kompleks serologiczny wirusa kleszczowego zapalenia mózgu 8.15.5. Inne flawiwirusy 8.16. Filowirusy - Marta Wróblewska 8.16.1. Rodzaje Ebolavirus i Marburgvirus 8.16.2. Rodzaj Cuevavirus 8.17. Rabdowirusy - Marta Wróblewska 8.17.1. Wścieklizna 8.17.2. Wirus pęcherzykowego zapalenia jamy ustnej 8.18. Buniawirusy - Marta Wróblewska 8.18.1. Rodzaj Nairovirus 8.18.2. Rodzaj Phlebovirus 8.18.3. Rodzaj Hantavirus 8.18.4. Rodzaj Orthobunyavirus 8.19. Arenawirusy - Marta Wróblewska 8.19.1. Wirus Lassa 8.19.2. Wirus limfocytarnego zapalenia splotu naczyniówkowego i opon mózgowych 8.19.3. Wirusy południowoamerykańskich gorączek krwotocznych 8.19.4. Inne arenawirusy patogenne dla ludzi 8.20. Retrowirusy - Marta Wróblewska 8.20.1. Rodzaj Deltaretrovirus 8.20.2. Rodzaj Lentivirus 8.20.3. Inne retrowirusy 8.21. Wirusowe zapalenia wątroby - Marta Wróblewska 8.21.1. Wirus zapalenia wątroby typu A 8.21.2. Wirus zapalenia wątroby typu B 8.21.3. Wirus zapalenia wątroby typu C 8.21.4. Wirus zapalenia wątroby typu D 8.21.5. Wirus zapalenia wątroby typu E 8.21.6. Wirus zapalenia wątroby typu G 8.21.7. Inne wirusy zapalenia wątroby 8.22 Priony - Marta Wróblewska 8.22.1 Epidemiologia chorób prionowych 8.22.2 Replikacja prionów i patogeneza zakażeń 8.22.3 Postacie kliniczne chorób prionowych 8.22.4 Diagnostyka chorób prionowych 8.22.5 Leczenie i profilaktyka chorób prionowych 9. Mykologia ogólna z patogenezą zakażeń grzybiczych - Anna B. Macura 9.1. Morfologia, metabolizm i rozmnażanie się grzybów 9.2. Klasyfikacja grzybów 9.3. Patogeneza zakażeń grzybiczych 9.3.1. Patogeneza zakażeń wywołanych przez grzyby drożdżopodobne 9.3.2. Patogeneza zakażeń wywołanych przez pleśnie 9.3.3. Patogeneza zakażeń wywołanych przez dermatofity 9.4. Epidemiologia i profilaktyka zakażeń grzybiczych 9.5. Mykotoksyny i mykotoksykozy 9.6. Grzyby jako alergeny 10. Mykologia szczegółowa 10.1. Grzyby drożdżopodobne (drożdże) - Anna B. Macura, Paweł Krzyściak 10.1.1. Workowce 10.1.2. Podstawczaki 10.1.3. Pneumocystis jirovecii 10.1.4. Profilaktyka zakażeń grzybami drożdżobodobnymi 10.2. Grzyby strzępkowe - Anna B. Macura, Magdalena Skóra 10.2.1. Sprzężniaki (Zygomycota) 10.2.2. Pleśnie z podtypu Pezizomycotina (typ Ascomycota) 10.2.3. Profilaktyka zakażeń grzybami strzępkowymi 10.3. Dermatofity - Anna B. Macura, Paweł Krzyściak 10.3.1. Trichophyton 10.3.2. Epidermophyton 10.3.3. Microsporum 10.3.4. Profilaktyka zakażeń dermatofitami 10.4. Grzyby dimorficzne - Anna B. Macura 10.4.1. Histoplasma capsulatum 10.4.2. Blastomyces dermatitidis 10.4.3. Coccidioides immitis 10.4.4. Paracoccidioides brasiliensis 10.4.5. Sporothrix schenckii 11. Parazytologia ogólna - Zbigniew Pawłowski 11.1. Podstawowe zagadnienia z zakresu parazytologii 11.1.1. Różnorodność w parazytologii 11.1.2. Proces inwazji 11.2. Mianownictwo i klasyfikacja systematyczna pasożytów człowieka 11.2.1. Mianownictwo 11.2.2. Klasyfikacja systematyczna pasożytów 11.3. Patogeneza i objawy chorób pasożytniczych 11.3.1. Wzajemne relacje pasożytów i człowieka jako ich żywiciela 11.3.2. Bezpośrednie mechanizmy patogenetyczne 11.3.3. Immunologiczne mechanizmy patogenetyczne 11.3.4. Reakcje nadwrażliwości na obecność pasożytów 11.3.5. Powikłania w chorobach pasożytniczych 11.4. Epidemiologia i profilaktyka inwazji pasożytniczych 11.4.1. Odrębność epidemiologii inwazji pasożytniczych 11.4.2. Proces epidemiologiczny 11.4.3. Dochodzenie epidemiologiczne i zapobieganie parazytozom 12. Parazytologia szczegółowa 12.1. Pierwotniaki 12.1.1. Giardia intestinalis - Agata Pietrzyk 12.1.2. Trichomonas vaginalis - Agata Pietrzyk 12.1.3. Leishmania spp. - Agata Pietrzyk 12.1.4. Trypanosoma spp. - Agata Pietrzyk 12.1.5. Entamoeba histolytica i pełzaki niechorobotwórcze - Małgorzata Paul 12.1.6. Inne pełzaki przewodu pokarmowego - Małgorzata Paul 12.1.7. Pełzaki wolno żyjące - Małgorzata Paul 12.1.8. Toxoplasma gondii - Małgorzata Paul 12.1.9. Cryptosporidium spp. - Małgorzata Paul 12.1.10. Kokcydia chorobotwórcze dla człowieka - Małgorzata Paul 12.1.11. Plasmodium spp. - Małgorzata Paul 12.1.12. Babesia spp. - Małgorzata Paul 12.1.13. Balantidium coli - Małgorzata Paul 12.1.14. Microsporidia - Małgorzata Paul 12.2. Robaki 12.2.1. Przywry - Małgorzata Paul 12.2.2. Tasiemce - Zbigniew Pawłowski 12.2.3. Nicienie przewodu pokarmowego - Agata Pietrzyk 12.2.4. Nicienie tkanek oraz krwi i limfy - Małgorzata Paul 12.2.5. Stawonogi - Zbigniew Pawłowski 13. Leki przeciwdrobnoustrojowe i antybiotykoterapia chorób zakaźnych 13.1. Zasady racjonalnej chemioterapii - Artur Drzewiecki 13.1.1. Farmakokinetyka 13.1.2. Farmakodynamika 13.1.3. Oporność bakterii i grzybów 13.1.4. Skojarzenia antybiotyków 13.1.5 Rodzaje farmakoterapii zakażeń 13.2. Leki przeciwbakteryjne - Danuta Dzierżanowska-Madalińska 13.2.1. Klasyfikacja, sposób działania i zastosowanie kliniczne 13.2.2. Mechanizmy bakteryjnej oporności na antybiotyki 13.2.3. Metody oznaczania wrażliwości na antybiotyki 13.3. Leki przeciwwirusowe - Marta Wróblewska 13.3.1. Interferony 13.3.2. Rybawiryna 13.3.3. Leki przeciw wirusom grypy 13.3.4. Leki przeciw herpeswirusom 13.3.5. Leki przeciwretrowirusowe 13.3.6. Leki stosowane w zakażeniu HBV 13.3.7. Leki stosowane w zakażeniu HCV 13.3.8. Przeciwwirusowe surowice odpornościowe 13.4. Leki przeciwgrzybicze - Danuta Dzierżanowska-Madalińska 13.4.1. Podział leków przeciwgrzybiczych 13.4.2. Metody oznaczania wrażliwości grzybów na antymykotyki 13.5. Leki przeciw inwazjom pasożytniczym - Jerzy Stefaniak 13.5.1. Zasady leczenia chorób wywoływanych przez pasożyty 13.5.2. Leki przeciw zarażeniom pierwotniakami 13.5.3. Leki przeciw robaczycom 13.5.4. Leki przeciw pasożytom zewnętrznym 14. Zakażenia szpitalne 14.1. Podstawowe pojęcia i definicje - Jadwiga Wójkowska-Mach 14.2. Czynniki ryzyka występowania zakażeń szpitalnych - Małgorzata Bulanda 14.3. Epidemiologia zakażeń szpitalnych - Jadwiga Wójkowska-Mach 14.4. Kontrola zakażeń - Jadwiga Wójkowska-Mach 14.5 Czynniki etiologiczne zakażeń szpitalnych - Małgorzata Bulanda 14.5.1. Wirusy jako czynniki etiologiczne zakażeń szpitalnych 14.5.2. Bakterie jako czynniki etiologiczne zakażeń szpitalnych 14.5.3. Grzyby jako patogeny w zakażeniach szpitalnych 14.6. Postacie kliniczne zakażeń szpitalnych 14.6.1. Podział zakażeń szpitalnych - Jadwiga Wójkowska-Mach 14.6.2. Zakażenie miejsca operowanego - Małgorzata Bulanda 14.7. Higiena szpitalna - Małgorzata Fleischer 14.7.1. Higiena rąk 14.7.2. Środki ochrony osobistej 14.7.3. Utrzymanie czystości pomieszczeń szpitalnych 14.8. Typowanie molekularne - Agnieszka Chmielarczyk 14.8.1. Analiza restrykcyjna chromosomalnego DNA połączona z elektroforezą pulsową 14.8.2. Metody oparte na technice PCR (wykorzystujące amplifikację DNA) 14.8.3. Analiza sekwencji metodą MLST 15. Bioterroryzm - Janusz Kocik, Marcin Niemcewicz, Anna Bielecka-Oder 15.1. Historia broni biologicznej 15.2. Podział czynników broni biologicznej 16. Diagnostyka mikrobiologiczna 16.1. Diagnostyka zakażeń bakteryjnych - Małgorzata Bulanda 16.1.1. Pobieranie i przesyłanie materiałów do badań bakteriologicznych 16.1.2. Klasyczne metody diagnostyczne 16.1.3. Etap polaboratoryjny 16.2. Diagnostyka zakażeń wirusowych - Maciej Przybylski, Tomasz Dzieciątkowski 16.2.1. Badania wirusologiczne 16.2.2. Diagnostyka serologiczna - wykrywanie przeciwciał 16.3. Diagnostyka zakażeń grzybiczych - Anna B. Macura, Magdalena Skóra 16.3.1. Pobieranie i przesyłanie materiałów do badań mykologicznych 16.3.2. Metody mikroskopowe i hodowlane 16.3.3. Metody immunologiczne 16.3.4. Metody molekularne 16.3.5. MALDI-TOF MS - laserowa desorpcja i jonizacja próbki wspomagana matrycą 16.4. Diagnostyka parazytologiczna - Małgorzata Paul 16.4.1. Pobieranie i przesyłanie materiałów do badań parazytologicznych 16.4.2. Diagnostyka pasożytów przewodu pokarmowego 16.4.3. Diagnostyka pasożytów krwi i tkanek 16.4.4. Metody biologii molekularnej w diagnostyce parazytologicznej 17. Zakażenia układowe i narządowe 17.1. Zakażenia układu oddechowego - Stefania Giedrys-Kalemba 17.1.1. Zakażenia górnych dróg oddechowych 17.1.2. Zakażenia dolnych dróg oddechowych 17.2. Zapalenie ucha - Stefania Giedrys-Kalemba 17.3. Zapalenie żołądka i jelit oraz zatrucia pokarmowe - Hanna Stypułkowska-Misiurewicz 17.4. Zakażenia narządów płciowych i układu moczowego - Magdalena Strus 17.4.1. Prawidłowa mikrobiota pochwy 17.4.2. Waginoza bakteryjna 17.4.3. Tlenowe zapalenie pochwy 17.4.4. Zakażenia układu moczowego 17.5. Choroby przenoszone drogą płciową - Piotr Kochan 17.6. Zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych i inne infekcje ośrodkowego układu nerwowego - Piotr Kochan 17.6.1. Czynniki predysponujące do infekcji OUN 17.6.2. Czynniki etiologiczne zakażeń i zarażeń OUN 17.6.3. Epidemiologia infekcji OUN 17.6.4. Zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych 17.6.5. Diagnostyka zakażeń OUN 17.6.6. Leczenie zakażeń OUN 17.6.7. Profilaktyka zakażeń OUN 17.7. Zapalenia wsierdzia - Artur Drzewiecki 17.8. Bakteryjne zakażenie skóry i tkanek miękkich -Małgorzata Bulanda 17.8.1. Zakażenia o etiologii gronkowcowej 17.8.2. Zakażenia o etiologii paciorkowcowej 17.8.3. Zakażenia powodowane przez Pseudomonas aeruginosa 17.8.4. Diagnostyka bakteryjnych zakażeń skóry i tkanek miękkich 17.8.5. Leczenie bakteryjnych zakażeń skóry i tkanek miękkich 17.9. Bakteryjne zakażenia kości i stawów - Małgorzata Bulanda 17.9.1. Zakażenia kości 17.9.2. Zakażenia stawów 17.9.3. Zakażenia narządu ruchu związane z obecnością ciał obcych 17.10. Zakażenia narządu wzroku - Małgorzata Bulanda 17.11. Bakteriemia i sepsa - Anna Przondo-Mordarska 17.11.1. Epidemiologia 17.11.2. Etiopatogeneza zakażeń krwi 17.11.3. Szczegółowy patomechanizm rozwoju sepsy 17.11.4. Obraz kliniczny zakażeń krwi 17.11.5. Diagnostyka mikrobiologiczna w sepsie 17.11.6. Leczenie antybiotykami 17.12. Inwazyjne zakażenia grzybicze - Danuta Dzierżanowska-Madalińska 17.12.1. Zakażenia grzybami drożdżopodobnymi 17.12.2. Zakażenia grzybami z rodzaju Aspergillus 17.12.3. Inne inwazyjne zakażenia grzybicze 17.12.4. Epidemiologia inwazyjnych zakażeń grzybiczych u osób z obniżoną odpornością 17.12.5. Diagnostyka i leczenie inwazyjnych zakażeń grzybiczych 17.13. Zakażenia wrodzone i okołoporodowe - Piotr B. Heczko, Magdalena Strus 17.13.1. Zakażenia wrodzone 17.13.2. Badania przesiewowe w celu wykrycia zagrożenia zakażeniami wrodzonymi 17.13.3. Zakażenia noworodków 17.14. Infekcje u chorych z obniżoną odpornością - Barbara Zawilińska 17.14.1. Pierwotne i wtórne niedobory odporności 17.14.2. Infekcje u pacjentów po przeszczepie narządów miąższowych i szpiku kostnego Piśmiennictwo Skorowidz